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算法与数据告诉你 | 拐点已到,抗疫即将胜利!!!

最近可能很多人跟我一样,起床第一件事就是看一眼疫情的数字与新闻。大家都在预测拐点何时会到,有了上次《算法告诉你|为什么乖乖宅在家里就是一线抗疫!》的经验,这次我们通过算法仿真以及对于数据的透视大胆分析预测一波拐点。然而在分析中我发现了一件不得了的事情,就是疫情的拐点已经来了

我知道你肯定会疑惑,确诊数字依然每天在增加啊,为什么就说拐点来了

因为这次病毒的确诊标准经历了全基因组测序,试剂盒北京分析,试剂盒下发当地分析,包含临床诊断病例这四个阶段,所以我们每天看到疫情数据走势图实际上是由四种不同确诊标准组合在一起的结果,实际上相当于四张不同的走势图拼在了一起,不能将它们合并在一起做判断。

四种不同确诊标准的阶段划分

由于这四种确诊标准由紧到松,漏诊的概率由大到小,所以疫情走势图在趋势的反映上有很大的滞后性,没法在拐点真正到来的时候准确反映出拐点。

前期漏诊率高导致数据表达的滞后性

疫情的拐点是控制住新增感染者数量的时刻。

那么怎么判断新增感染者的数量是不是被控制住了呢?我们用算法仿真透视数据两个角度分别验证。

首先就是大力出奇迹的算法仿真参考英国帝国理工关于再生数的研究结果,再将疫情发展强度随时间进行划分:

第一阶段:2019年12月1日至2020年1月23日,武汉封城之前,R0=3.1(高流行传播阶段)

第二阶段:1月24日-2月1日,武汉逐步建立交通管制和隔离检疫制度以限制人口流动,Rt = 2.6(中等流行传播阶段)

第三阶段:2月2日-6日, 武汉的社区防控得到加强,提出了“不漏一户、不漏一人” 的社区公共卫生管理模式;Rt = 1.9(低流行传播阶段)

第四阶段:2月上中旬,武汉的防控措施进一步加强,采取严格的社区隔离和疑似感染者的全面筛查政策,新冠肺炎患者基本实现“应收尽收、应治尽治”,Rt = 0.9或0.5(疫情逐步平息阶段)

直接用SEIR模型直接得出数据,疫情拐点在20号左右出现。

SEIR模型再生数多阶段取值分析

然后我们再透视现有的数据来验证这个结果。

我们把每个地区有武汉接触史的人口数量与每个地区的确诊人数放在一起,我们可以发现几乎所有的城市都落在一条直线的两侧,而武汉现在也落在了95%的置信区间内。

武汉接触史与累计确诊人数的关系,参考知乎chenqin

这表明应收尽收”真的做到了,武汉同全国其他地区一样,绝大部分的发病患者被甄别隔离出来了。同时也意味着尽管武汉目前的确诊基数很大,但是武汉的传染率已经降到了全国其他地区的平均水平,武汉疫情往后的走势会与全国一致

这里我们会发现第一个反直觉的现象:武汉新增确诊人数越多,反而说明我们对疫情控制的越好。因为现实的逻辑是,武汉的数据在回归线下方时,武汉新增确诊人数越少,就意味着越多的感染者被漏诊,这些人又会传染更多的人。

紧接着我们又会发现第二个反直觉的现象:这些感染者为什么会被漏诊呢。因为在2.12包含临床诊断病例以前,湖北的新增确诊稳定在3000例左右,看似平稳发展啊。但现实的逻辑是,3000不是一个真实的数字,而是7000(份检测能力)*40%(30%~50%的阳性率)约等于3000,是武汉测试能力×阳性率的量程上限。所以2.12号以前的确诊数据的失真度非常高,以至于现在都无从知晓真实数据是量程上限的多少倍

海水不可斗量就是这个道理。

之后我们可以发现第三个反直觉的现象,就是尽管各地的防控水平有好有坏,但是防控措施对累计确诊造成的影响却微乎其微。现实的逻辑是如果防控措施有100分,那我们的各个地区都做到了100+的分数,以至于各个地区之间防控的差异在分数上反映不出来

另外一个侧面验证的数据是CDC 18日发表的论文,其中医护人员的感染在2月快速下降,说明了2月以来尽管确诊病例在增加,但是医疗资源的压力却在减小对疫情的控制越来越游刃有余

武汉医护人员感染数量下降明显

参考《柳叶刀》1.31号发表的港大论文中的模型,我们可以判断现有的防控强度下,疫情不会再有反弹了,会以右下角的模式发展,新增病例会较快的回落到非常少的水平

不同传染率与防控水平下疫情的发展模式

现在我们基本可以判断疫情的拐点已经不声不响的到了那么拐点来的不声不响是因为我们对疫情防控的不利嘛?

拐点到来的时间与疫情严重程度的关系

并不是!这里我们可以发现第四个反直觉的现象,就是拐点来的越晚越不明显就意味着我们对疫情控制的越好。因为拐点来越早,就意味着病毒越容易感染能够感染到的人,数据图形上看到的拐点特征越明显,意味着防控水平差。而拐点来的越晚,证明病毒传播的越慢,意味着防控水平越好。防控水平到了极限就是一条近似的水平线,证明好到了没有狂澜可以被用来力挽

所以综合算法与数据,我们可以判断这次疫情的拐点已经来了未来新增确诊会继续降低,于此同时治愈出院的人数一周后会超过新增确诊,在院人数会迅速下降迅速进入疫情的收尾阶段,估计全国三月底就可以放心出门了,武汉晚一个月四月底疫情结束

最后还是劝大家在最终胜利前还是不能放松警惕,因为城市比我们想象的要脆弱很多

BOID算法模拟:放松防控条件下,上海复工时的疫情爆发

参考:

1中国疾病预防控制中心.新型冠状病毒肺炎流行病学特征分析.中华流行病学杂志.[2020-02-18]

2.Joseph T Wu,Kathy Leung,Gabriel M Leung.Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a modelling study.Lancet.https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30260-9.[2020-01-31]

3.卫健委新闻发布会.http://www.nhc.gov.cn/

4.Imai, N. et al. Report 3: Transmissibility of 2019-nCoV.https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news–wuhan-coronavirus/

5.最新!交大医学院团队分阶段估计武汉市新冠肺炎疫情趋势. https://mp.weixin.qq.com/s/iN82eHSTMUHzEL9DhTpV1

6.chenqin.2月16日全国新增新冠肺炎2048例,累计确诊70548例,目前防治情况如何?.https://www.zhihu.com/question/372448321/answer/1021513053

7.中国疾病预防控制中心.http://www.chinacdc.cn/

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作者: ganggouren

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